Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek3Q9R0A5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms