Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms