Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms