Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phtf1Q9QZ09 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms