Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx4Q9QY61 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms