Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad18Q9QXK2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad18Q9QXK2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms