Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms