Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms