Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a1Q9QX15 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms