Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Homer2Q9QWW1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms