Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms