Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolkQ9QUG2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolkQ9QUG2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms