Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Csnk1eQ9JMK2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1eQ9JMK2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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