Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hdgfl3Q9JMG7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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