Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp3a41aQ9JMA7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp3a41aQ9JMA7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms