Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms