Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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