Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc4apQ9JLV2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms