Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp2Q9JLK4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp2Q9JLK4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp2Q9JLK4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp2Q9JLK4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cabp2Q9JLK4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp2Q9JLK4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms