Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms