Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LitafQ9JLJ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LitafQ9JLJ0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LitafQ9JLJ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms