Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
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