Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms