Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms