Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms