Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms