Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra4Q9JJT2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms