Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms