Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms