Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms