Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpxQ9JHS4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpxQ9JHS4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClpxQ9JHS4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClpxQ9JHS4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpxQ9JHS4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpxQ9JHS4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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