Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn12Q9ET43 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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