Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms