Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tm9sf3Q9ET30 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms