Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
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Rb1cc1Q9ESK9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
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Rb1cc1Q9ESK9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rb1cc1Q9ESK9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms