Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp29Q9ES63 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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