Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms