Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.4 ms