Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms