Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms