Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms