Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp4Q9ER80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms