Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn2Q9ER65 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms