Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox9Q9EQM5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms