Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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