Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms