Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms