Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a3Q9DCP2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms