Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCA5

Brix1, Ribosome biogenesis protein BRX1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brix1Q9DCA5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brix1Q9DCA5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms