Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms